使用二类射线装置辐射安全许可证应由生产、销售、使用放射性同位素和射线装置的单位负责办理。这些单位需按照《中华人民共和国放射性污染防治法》第二十八条的规定，依据国务院有关放射性同位素与射线装置放射防护的规定申请领取许可证，并办理相关登记手续。
一、办理辐射安全许可证的法律依据
《中华人民共和国放射性污染防治法》明确要求，生产、销售、使用放射性同位素和射线装置的单位必须申请领取许可证。
《放射性同位素与射线装置安全和防护条例》第十五条规定，禁止无许可证或者不按照许可证规定的种类和范围从事相关活动，进一步强调了许可证的重要性。
二、辐射安全许可证的办理流程
具体办理流程可能因地方差异而略有不同，但一般包括以下步骤：
在全国核技术利用辐射安全申报系统进行网上申报，并打印填好的表格。
携带相关材料至当地环保局（或国土环保局）提出申请。
环保局审核人员对材料进行审核，审批通过的，打印制作《辐射安全许可证》。
通知申请人领取或邮寄《辐射安全许可证》。
三、违反规定的法律责任
若违反《放射性同位素与射线装置安全和防护条例》的相关规定，如伪造、变造、转让许可证的，将会受到法律制裁，包括但不限于罚款、吊销许可证，甚至追究刑事责任。
综上所述，使用二类射线装置辐射安全许可证的办理是法律要求的必要步骤，相关单位应严格遵守法律法规，确保辐射活动的安全与合规。